Medizin, Mathematik (Bonn; Köln 1968-1976)
Promotion (Köln 1976)

Habilitation (1984): Epidemiologische, immunologische und molekularbiologische Untersuchungen an Picornaviren. Ein Beitrag zur Pathogenese und Diagnostik von Enterovirusinfektionen, Köln 1984.

Wiss. Angestellter (Köln 1977-1985)
Facharzt für Mikrobiologie und Infektionsepidemiologie (Köln 1983)
Habilitation (Köln 1984) 
Professor für Virologie (Köln auf Zeit, 1985-1991) 
Professor für Virologie (Köln 1991-1998)
o. Professor für Virologie und Ärztlicher Direktor Institut für Virologie (Ulm 1998-2018)

Studiendekan Molekulare Medizin (2010-2016)

Wiss. Beirat Bundesamt für Sera und Impfstoffe (PEI) (1992-1995)
Kommission nach § 2 5 Abs. 6 AMG des BfArM, Berlin-Bonn (1999-2004)
Leiter Konsiliarlabors CMV Robert Koch-Institut (1995-2017) 
Ständige Impfkomission (2004-)
Vorsitzender Impfkomission (2017-) 
Präsident Gesellschaft für Virologie (2011-2017)
Vorsitzender Stiftungsrat Deutsche Leberstiftung (2007-)
Nationale Kommission für die Polioeradikation in Deutschland (2011-) 
Expertenbeirat Influenza Robert Koch-Institut (2012-)

Robert Koch Institut. Online. Eintrag "Prof. Dr. Thomas Mertens". URL: https://www.rki.de/DE/Content/Kommissionen/STIKO/Mitgliedschaft/Mitglieder/Profile/Mertens_Profil.html (07.02.2021)
https://www.uniklinik-ulm.de/aktuelles/detailansicht/news/renommierter-ulmer-virologe-geht-in-den-ruhestand.html (07.02.2021) 
Wikipedia. Online. Artikel "Thomas Mertens". URL: https://de.wikipedia.org/wiki/Thomas_Mertens (07.02.2021)